Vicerector y Rector de la Universidad de Alicante desde el año 1996 al  98, continuó su andadura en Bruselas, como responsable de Propiedad Intelectual y nuevas tecnologías de la Comisión Europea. Posteriormente fue nombrado Vicepresidente de la Oficina de Patentes Europea en Múnich donde estuvo en el puesto prácticamente 8 años. Pese a su dilatada carrera nunca ha dejado de ser Catedrático de Derecho Internacional Privado, donde ha permanecido ejerciendo docencia desde hace casi 30 años. Actualmente es Consejero en el Elzaburu, empresa dedicada a la protección de la Propiedad Intelectual e Industrial de empresas. Manuel Desantes asesora a multitud de jóvenes con ideas y participa activamente en numerosos proyectos innovadores.

Manuel colabora con el ISC como asesor de la iniciativa global y ha participado como ponente y icebreaker en el Internet Startup Camp 2012 y el Internet Startup Camp 2013.